Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trex2Q9R1A9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trex2Q9R1A9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms