Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms