Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp11cQ9QZW0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms