Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 925 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Npas3Q9QZQ0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Npas3Q9QZQ0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Npas3Q9QZQ0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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