Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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Usp21Q9QZL6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp21Q9QZL6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms