Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ubxn8Q9QZ49 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ubxn8Q9QZ49 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms