Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Snai3Q9QY31 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms