Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Opn4Q9QXZ9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Opn4Q9QXZ9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Opn4Q9QXZ9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn4Q9QXZ9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn4Q9QXZ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn4Q9QXZ9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn4Q9QXZ9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Opn4Q9QXZ9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn4Q9QXZ9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn4Q9QXZ9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Opn4Q9QXZ9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Opn4Q9QXZ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Opn4Q9QXZ9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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