Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nufip1Q9QXX8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nufip1Q9QXX8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms