Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Kcnip3Q9QXT8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms