Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip4Q9QXN3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trip4Q9QXN3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms