Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN0

Shroom3, Protein Shroom3, mousemouse

Predictions only

Length 1,986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom3Q9QXN0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shroom3Q9QXN0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms