Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ChmQ9QXG2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms