Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trp53inp1Q9QXE4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trp53inp1Q9QXE4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms