Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim44Q9QXA7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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