Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rai2Q9QVY8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms