Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk3Q9QUN9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms