Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cln8Q9QUK3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms