Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1eQ9JMK2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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