Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ap3b2Q9JME5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms