Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sfmbt1Q9JMD1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms