Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrfQ9JM73 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SrfQ9JM73 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SrfQ9JM73 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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SrfQ9JM73 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SrfQ9JM73 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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