Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rabgef1Q9JM13 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rabgef1Q9JM13 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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