Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd2apQ9JLQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd2apQ9JLQ0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms