Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SacsQ9JLC8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SacsQ9JLC8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms