Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKZ2

Slc5a3, Sodium/myo-inositol cotransporter, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a3Q9JKZ2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc5a3Q9JKZ2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc5a3Q9JKZ2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms