Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Upk3aQ9JKX8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms