Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pole3Q9JKP7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pole3Q9JKP7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms