Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Stx6Q9JKK1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stx6Q9JKK1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms