Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nectin1Q9JKF6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms