Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Msgn1Q9JK54 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Msgn1Q9JK54 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms