Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ube2j1Q9JJZ4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ube2j1Q9JJZ4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ube2j1Q9JJZ4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ube2j1Q9JJZ4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ube2j1Q9JJZ4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube2j1Q9JJZ4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ube2j1Q9JJZ4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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