Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sh3bgrlQ9JJU8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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