Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Efcc1Q9JJF6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Efcc1Q9JJF6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Efcc1Q9JJF6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Efcc1Q9JJF6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Efcc1Q9JJF6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Efcc1Q9JJF6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms