Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms