Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad9Q9JIW5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms