Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Slc12a4Q9JIS8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc12a4Q9JIS8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms