Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl28Q9JIL2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ccl28Q9JIL2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms