Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim39Q9ESN2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim39Q9ESN2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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