Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc28a3Q9ERH8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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