Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms