Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SgshQ9EQ08 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms