Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ropn1lQ9EQ00 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms