Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tspan4Q9DCK3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tspan4Q9DCK3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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