Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ndufa8Q9DCJ5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ndufa8Q9DCJ5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms