Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pop7Q9DCH2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms