Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trmt112Q9DCG9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trmt112Q9DCG9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms