Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Xab2Q9DCD2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Xab2Q9DCD2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms