Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Syde1Q9DBZ9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms