Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Swt1Q9DBQ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Swt1Q9DBQ9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Swt1Q9DBQ9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Swt1Q9DBQ9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Swt1Q9DBQ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Swt1Q9DBQ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Swt1Q9DBQ9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Swt1Q9DBQ9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Swt1Q9DBQ9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms